علی لاریجانی در طول کار سیاسی خود با چالش‌هایی مانند مناقشات خانوادگی با صادق لاریجانی بر سر انتصابات قضایی، انتقاد از عملکرد مدیریت صدا و سیما، و اتهامات اقتصادی شامل گزارش‌های شفافیت مالی روبرو شده‌است. این موارد در رسانه‌ها و پارلمان ایران مطرح شده‌اند.